জিএসটির ক্ষতিপূরণ নিয়ে কেন্দ্রের প্রস্তাবের বিরুদ্ধে এখনো পর্যন্ত মত দিয়েছে অধিকাংশ রাজ্য৷ তাই ক্ষতিপূরণও ইস্যুতে জটিলতা দেখা দিয়েছে। কেন্দ্রীয় সরকারের ঋণ গ্রহণের প্রস্তাবের বিপক্ষে মত দিয়েছে ১০ টি রাজ্য। তাদের পক্ষে মতামত পোষণ করেছে সাতটি রাজ্য। ওই সাতটি রাজ্যে অবশ্য এনডিএ শাসিত। যদিও সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য বিপক্ষে মতামত পোষণকারী রাজ্যগুলির মধ্যে তামিলনাড়ু, তেলেঙ্গানা, ওড়িশার মতো বিজেপির বন্ধু দলের সরকার রয়েছে তারা জিএসটির ক্ষতিপূরণ নিয়ে কেন্দ্রের প্রস্তাবে রাজি নয় এই টানাপোড়েনের জেরিন জিএসটি কাউন্সিলের বৈঠকে এই ইস্যুতে মতৈক্য না হলে ভোটাভুটি একপ্রকার নিশ্চিত।
ঠিক হয়েছিল যে ১১ সেপ্টেম্বর একটি মিনি জিএসটি কাউন্সিলের বৈঠক হবে। ১৯ সেপ্টেম্বর আরও একটি বৈঠকে বিভিন্ন পণ্য ও পরিষেবা জিএসটি কমানো নিয়ে সিদ্ধান্ত নেওয়া হবে। তার আগেই ১১ সেপ্টেম্বর ক্ষতিপূরণ সংক্রান্ত সমস্যা সমাধান করতে চাইছিল কেন্দ্র। কিন্তু শেষ মুহূর্তে বৈঠক বাতিল করতে হয় কারণ রাজ্যগুলির ভিন্ন মতামত রয়েছে তাই আরো কিছুটা সময় চাইছে কেন্দ্র। তবে পরিস্থিতি যে দিকে এগোচ্ছে তাতে ভোটাভুটি হওয়া প্রায় নিশ্চিত। কারণ কেন্দ্র যে প্রস্তাব দিয়েছে তা অধিকাংশ রাজ্যের পক্ষে মেনে নেওয়া সম্ভব নয় বলে তারা জানিয়ে দিয়েছে।
